有機耕作主要有以下方法:不使用化學物質進行植保,在適應的植物輪作上盡量少選用易受感染品種,選擇合適的品種并用物理方式管理,如中耕和燃燒除草,不使用易溶解的礦物質肥料,主要使用有機的含固體氮成分的糞類或復合肥,利用固氮植物(豆科植物類)環保施肥,并且使用緩慢見效的天然肥料,通過集中腐殖質管理保持土壤肥沃,使用多種植物輪作或間作進行多樣和長期的植物輪作,不使用對生長有調控和激素作用的合成化學物質。保持有限的,務必與土地關聯的儲存密度,使用農作物秸稈或青飼料飼養動物,如果可能,幾乎不購買飼料,盡量少用抗生素。